Generating semantic networks to the PubMed

This paper presents a topic map approach to PubMed in order to create a knowledge representation for this information system. PubMed is a free search engine that gives very full coverage of the related biomedical sciences. With more than 17 millions of citations since 1865, PubMed users have several problems to find the papers desired. So, it is necessary to organize these concepts in a semantic network. To achieve this objective, we use the Metamorphosis system, choosing the keywords from MeSH ontology. This way, we obtain an ontological index for PubMed, making easier to find specific papers

Projeto Rondon: a multidisciplinaridade como fator de transformação no Município de itapuã do Oeste/RO

Anais do 35º Seminário de Extensão Universitária da Região Sul - Área temática: ComunicaçãoO Projeto Rondon, coordenado pelo Ministério da Defesa, promove a intervenção social executada por estudantes universitários, incentivando trocas de conhecimentos e experiências. Desta forma o presente trabalho visa destacar considerações sobre a participação dos acadêmicos e docentes do Instituto Federal Farroupilha, Campus São Vicente do Sul na Operação Cinquentenário do Projeto Rondon. Participaram da operação acadêmicos de diversos cursos e professores do IFFar, campus São Vicente do Sul, os quais desenvolveram atividades no município de Itapuã do Oeste/RO. As oficinas foram elaboradas seguindo os eixos de comunicação, trabalho, meio ambiente e tecnologia e produção. De acordo com a aplicação das oficinas no município, o eixo que apresentou um número maior de participantes, foi o de comunicação, mas é importante salientar que a participação dos demais eixos é essencial, para que desta forma ocorra a interligação e a multidisciplinaridade entre as áreas. Os resultados do Projeto Rondon, foram satisfatórios tanto para a comunidade, quanto para os acadêmicos, pois possibilitou a troca de experiências e também de vivenciar outra realidad

Topic maps applied to PubMed

This paper presents a topic map approach to PubMed in order to create a knowledge representation for this information system. PubMed is a free search engine that gives very full coverage of the related biomedical sciences. With more than 17 millions of citations since 1865, PubMed users have several problems to find the papers desired. So, it is necessary to organize these concepts in a semantic network. To achieve this objective, we use the Metamorphosis system, choosing the keywords from MeSH ontology. This way, we obtain an ontological index for PubMed, making easier to find specific papers.(undefined

ARQUITETURA DE UM SISTEMA DE CONSULTAS E VISUALIZAÇÃO GRÁFICA DA REPRESENTAÇÃO DO CONHECIMENTO CONTIDO NO PUBMED

Made available in DSpace on 2018-06-27T18:56:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Henrique Tamiosso Machado.pdf: 2591851 bytes, checksum: b09aea9b36e9a9f1d51baa431dec4f93 (MD5) Henrique Tamiosso Machado.pdf.jpg: 3371 bytes, checksum: 9b313eea24e6b21e8cdba71fdc2e37be (MD5) Previous issue date: 2009-03-12Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorIn the bioinformatics has a great amount of biological and genetic information that serve of support for research, and each day this amount of information grows more. Diverse research made for many researchers in different areas, as molecular biology, structural biochemist, enzymology, physiology, pathology, among others, comes generating some results and information that must be stored to be used in the diverse forms. But there the problem appears, how to store, to manipulate, to visualize all these information? The bioinformatics uses the computational power to catalogue, to organize, to structuralize and to manipulate these information facilitating the use of these information that are of extreme importance for Biology. The PubMed is a service of the National Library of Medicine of United States that supplies access to more than 18 million citations for periodical scientific articles in the area of health science. In order to consider a new boarding for the search and representation of the knowledge found in the gotten result, this work presents the use of norm ISO 13250 Topic Maps for the creation of semantic nets involving the concepts found in the system of information of the PubMed, the construction of a composed architecture for a data base with deriving information of the PubMed by the National Library of Medicine of the United States (NLM), an interface for different research of the available one for the Entrez system, where it is possible to define priorities for the consultations. Also is possible to make the representation of the knowledge contained in the PubMed through semantic nets and techniques of date mining.Na bioinformática existe uma grande quantidade de informações biológicas e genéticas que servem de suporte para pesquisas, e a cada dia essa quantidade de informações cresce ainda mais. Diversas pesquisas realizadas por inúmeros pesquisadores de diferentes áreas como biologia molecular, bioquímica estrutural, enzimologia, fisiologia, patologia, entre outras, vem gerando vários resultados e informações que devem ser armazenadas para serem utilizadas de diversas formas. Mas aí que surge o problema, como armazenar, manipular, visualizar todas essas informações? A bioinformática usa o poder computacional para catalogar, organizar, estruturar e manipular essas informações de uma forma que facilite a utilização dessas informações que são de extrema importância para a Biologia. O PubMed é um serviço da Biblioteca Nacional de Medicina dos Estados Unidos (U.S. National Library of Medicine) que fornece acesso para mais de 18 milhões de citações para artigos científicos de jornais da área de ciências da saúde. De modo a propor uma nova abordagem para a busca e representação do conhecimento encontrado no resultado obtido, este trabalho apresenta uma arquitetura de um sistema para consultas utilizando prioridades e visualização das informações através de redes semânticas para representar o conhecimento contido no PubMed, para isso, foi utilizado a norma ISO 13250 Topic Maps para a criação de redes semânticas envolvendo os conceitos encontrados no sistema de informação do PubMed, realizado o desenvolvimento de uma arquitetura composta por um banco de dados com informações oriundas do PubMed disponibilizadas pela Biblioteca Nacional de Medicina dos Estados Unidos (NLM), uma interface para pesquisa diferente da disponibilizada pelo sistema Entrez, onde seja possível definir prioridades para as consultas. E também fazer a representação do conhecimento contido no PubMed através de redes semânticas e técnicas de data mining